Heru juga sebelumnya pernah menjabat sebagai Wali Kota Jakarta Utara pada 2014 ketika Joko Widodo masih menjabat sebagai Gubernur DKI Jakarta. Ia menggantikan Bambang Sugiyono yang sebelumnya sudah jadi Wali Kota Jakut terlebih dahulu.
Belum selesai mengemban amanahnya hingga rampung, kemudian itu diangkat Ahok untuk menjadi Kepala Badan Pengelola Keuangan Aset Daerah DKI Jakarta. Selain itu, ia juga pernah sempat akan menjadi Calon Wakil Gubernur DKI bersama Ahok pada Pilkada tahun 2017 melalui jalur independen. Namun hal tersebut kemudian urung dilakukan karena Ahok akhirnya maju di Pilkada dengan Djarot Saiful Hidayat dan diusung PDIP.(*)