Untuk diketahui, tujuan dari pembentukan Kemenag adalah untuk memenuhi tuntutan sebagian besar rakyat beragama di Tanah Air yang merasa urusan keagamaan di zaman penjajahan dahulu tidak mendapat layanan yang layak. Namun, juga agar hal yang berkaitan dengan urusan keagamaan diurus serta diselenggarakan oleh suatu instansi atau kementerian khusus, sehingga pertanggungan jawab, beleid dan taktis berada di tangan seorang menteri.
Akan tetapi, pada saat itu ada juga yang menyampaikan protesnya, kenapa saat ini ada ‘hadiah’ afirmasi untuk pendidikan agama Kristen, Katolik, Hindu dan Budha. Ia pun menjelaskan, NU merupakan organisasi besar yang notabene yang kuat melindungi yang lemah.
“Jadi kalau sekarang Kementerian Agama menjadi kementerian semua agama, itu bukan menghilangkan ke-NU-annya, NU terkenal paling toleran dan moderat. Saya kira tidak ada yang salah. Nah itu kira-kira menjadi landasan cara berpikir kami (Kemenag untuk semua agama) di Kementerian Agama yang InsyaAllah sudah hampir seragam,” tandas dia.
